2016年匯算清繳時，對研發費用稅前加計扣除的申報，根據總局2017年第12號公告規定，在年度納稅申報時應當按照總局公告2015年97號（以下簡稱97號公告）規定，附報《研發費用可加計扣除研究開發費用情況歸集表》（以下簡稱歸集表）， 在填報年度納稅申報表（A類，2014年版）之《研發費用加計扣除優惠明細表》（A107014）時，僅填寫第10行第19列“本年研發費用加計扣除額合計”，數據來源為歸集表序號11“十一、當期實際加計扣除總額”行次填寫的“發生額”。即舊的研發費加計扣除申報表填報順序是填寫輔助帳，根據輔助帳填匯總表，根據匯總表填歸集表，根據歸集表填申報表。

新的2017年版《企業所得稅年度納稅申報表》修訂了A107012《研發費用加計扣除優惠明細表》，體現在七個方面：

一是表頭增加一般企業、科技型中小企業勾選項，新增了本年可享受研發費用加計扣除項目數量等內容。

二是對于其他相關費用，第29行不參與加計扣除計算，第35行才參與計算，第35行應<=第29行，第35行應<=第3行*10%。三是第36-38行，反映了委托研發加計扣除的政策：委托研發按照委托方實際支付給受托方費用的80%加計扣除；委托境外研發的不得加計扣除。

四是第44行-45行，是總局2017年第40號公告對于扣減特殊收入的規定：企業取得研發過程中形成的下腳料、殘次品、中間試制品等特殊收入，在計算確認收入當年的加計扣除研發費用時，應從已歸集研發費用中扣減該特殊收入，不足扣減的，加計扣除按零計算。

五是第46行-48行，反映了對當年銷售研發活動直接形成產品或作為組成部分形成的產品對外銷售的，研發費用中對應的材料費用不得加計扣除。產品銷售與對應的材料費用發生在不同納稅年度且材料費用已計入研發費用的，可在銷售當年以對應的材料費用發生額直接沖減當年的研發費用，不足沖減的，結轉以后年度繼續沖減。

六是第44行允許扣除的研發費用合計，等于第40行+第42行+第43行的值，體現了允許扣除的研發費用是本年費用化金額與本年和以前年度形成無形資產的攤銷額的合計。

七是一般企業第49行加計扣除比例為50%，第50行數據帶入A107010表第26行；科技型中小企業，第49行比例為75%，第50行數據帶入A107010表第27行，如果創意設計支出已填入A107010表第28行，則本表中應將費用剔除。

通過上述比較分析，我們可以發現新的《研發費用加計扣除優惠明細表》落實政策更精準，填報更便捷，其中變化最大的是（四）和（五），對特殊收入和形成產品對外銷售對應的材料費用的扣減，不再是調減直接相關費用——材料，而是在計算出允許扣除的研發費用合計數后進行沖減，體現了調表不調輔助帳的思路，但是目前在用的輔助帳、匯總表和歸集表是總局公告2015年第97號的附件，建議結合新出臺的研發費用加計扣除文件和2017年版企業所得稅年度申報表做出相應修改和優化。